人类X染色体上的RNA结合密度与22个常染色体上的不同
摘要：X染色体的RNA结合密度与其他22个常染色体进行比较，以检测X染色体是否具有独特的基因组特征。染色体的核苷酸序列被分割成每段50kb的片段，将这些片段编码为使用所有可能的7个核苷酸（7nt）字符串的频率值集合，可获得16384个字符串。选择在扁桃体生发中心B细胞中高表达的120个基因，计算其所有内含子（RNA）的7nt字符串频率值。DNA片段和RNA的结合密度通过互补序列的数量来确定。首次证明，基因较少且基因表达较低的X染色体具有高度结合RNA的DNA片段的最低百分比，而基因丰富且基因表达较高的染色体19具有最高百分比的片段。基于这些结果，推测RNA高度结合DNA片段在染色体上的非随机分布特性提供了X染色体失活的可能原因的强有力证据。
作者：Zhanjun Lu, Ying Lu, Shuxia Song, Zhai Yu, Xiufang Wang
论文ID：q-bio/0312039
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2007-05-23