在中等尺度上对DNA构象转变进行建模
摘要:DNA结构在介观尺度上的构象变化描述方法的方法被提出。通过考虑DNA结构元件沿构象路径的共同运动,可以以统一的两组分形式构建不同转化的模型。模型的一个组分是弹性杆的自由度,另一个组分是构象转化的有效坐标。内部和外部模型组分相互关联,这是DNA结构组织的特点。表明异质DNA的构象转化的动能可以用均质形式表示。在发展的方法框架内,找到了稳态状态之间的DNA结构的静态激发,内部和外部组分都有。所获得的数据与固有DNA变形实验的对比结果显示了很好的定性一致性。得出结论,发现的DNA结构激发可以被分类为静态构象孤立子。
作者:S.N.Volkov (Bogolyubov Institute for Theoretical Physics, Kiev)
论文ID:q-bio/0312034
分类:Biomolecules
分类简称:q-bio.BM
提交时间:2009-09-29