熵驱动调控的粗粒化模型
摘要：蛋白质与DNA等底物的结合在分子生物学中具有许多信号传导功能，可以响应环境信号（如小分子的同时结合）。例如，抑制蛋白可能通过配体结合引起构象变化来传递信息。一种备选的熵驱动的“异构作用”机制表明，诱导剂配体不仅会改变静态结构，还会改变分子内振动熵。我们提出了一种量化的粗粒化模型来描述熵驱动的异构作用，从而提出了使用这种效应的蛋白质内部协同势的设计规则。它还解决了信号信息如何通过蛋白质传递以结合或解离的问题。该模型可能适用于广泛的抑制剂，还适用于跨膜蛋白的信号传导。
作者：Rhoda J. Hawkins and Thomas C. B. McLeish
论文ID：q-bio/0311023
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-10