蛋白质二级结构预测：隐马尔可夫模型与滑动窗口分数的组合
摘要：通过提出确定性的五元素构象状态来反映构象相关性，而不是单个残基的构象状态。我们采用简单的隐藏马尔科夫模型结合滑动窗口得分来预测蛋白质的二级结构。由于蛋白质构象片段的长度变化在一个较窄的范围内，所以我们忽略了长度分布的持续性影响。残基的窗口得分是在条件独立性近似下估计的Chou-Fasman倾向性的窗口版本。我们尝试了不同的窗口宽度，发现最佳宽度为17。我们取得了约70\%的高准确率。
作者：Wei-Mou Zheng
论文ID：q-bio/0310026
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2007-05-23