差异疏水性驱动亨廷顿病的自组装
摘要：识别引物-外显子1对亨廷顿病进展的驱动力和关联机制是找到潜在药物靶点以及最终治愈的重要先决条件。我们在这里介绍了一个基于外显子1片段与阻塞共聚物的物理化学性质之间的关键类比的建模框架。我们采用了一种系统的介观尺度方法，基于耗散粒子动力学，能够克服动力学障碍，从而捕捉到比之前考虑的更大系统更长时间的动态。我们的结果揭示了与迄今为止忽略的(基于脯氨酸的)外显子1片段余氨酸多聚体区块相比的相对亲水性在自组装过程的启动中构成了一个主要因素。我们发现，外显子1的浓度和多谷氨酸多聚区的长度都对组装起到了调控作用，即使在我们考虑的最低体积分数下，也存在对结合的低阈值。此外，这种自组装发生在谷氨酸多聚区域处于随机卷曲或发夹构型时，分别导致球状或圆柱状的组装体。我们讨论了这些结果在这一背景下重新解释现有研究的含义，包括外显子1聚集的途径可能与广为研究的同源多谷氨酸肽片段的聚集途径不同。
作者：Martin G. Burke, Rudiger Woscholski, Sophia N. Yaliraki
论文ID：q-bio/0309017
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2009-11-10