微阵列数据可靠性和基因表达的概率估计
摘要：基于信息论的方法在复制基因表达数据中提供了一种定量测量两个重要参数类别的方法：首先，给定在某个变异中的样本中观察到的表达量S的情况下，基因处于生物状态σ的概率P(σ | S)；其次，样本特定的错误概率，这些错误概率作为每个变异的测量样本的一致性指标。该方法及其局限性在发育中的小鼠B细胞基因表达数据上进行了测试，并使用t检验作为参考。在一组已知基因上，尽管仅将其分为两个表达水平，该方法的性能优于t检验。一致性指标，即错误概率，与生物材料的变异相关，并证明其有效性。该方法在确定复制的微阵列数据中的差异基因表达和样本可靠性方面是有效的。在每个样本中仅有两个离散的表达水平时，它对数据给出了很好的解释，并且与标准技术相当。
作者：S. Bilke, T. Breslin, M. Sigvardsson
论文ID：q-bio/0309006
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2007-05-23