DNA中的熵弹性与永久弯曲
摘要：蛋白质与细胞中的双链DNA相互作用并使其变形。单分子实验已经研究了与螺旋变形蛋白质（包括弯曲DNA的蛋白质）结合的DNA的弹性。这些实验增加了需要包括螺旋变形蛋白质的DNA弹性理论的需求。以前对弯曲DNA的理论工作研究了一条长DNA分子，其中有许多非特异性结合蛋白质。然而，最近的实验使用了相对较短的DNA分子，其中有一个单一、明确定义的弯曲位点。在这里，我们开发了一个简单的理论描述单一弯曲的效果。然后，我们将这种弯曲的描述包含在有限蠕虫链模型（FWLC）中，该模型描述了与珠子结合的短DNA分子。我们预测了由于形成单个永久性扭结而导致的DNA力-延伸关系在所有应用拉伸力值时的变化。我们的预测表明，高分辨率的单分子实验可以确定蛋白质结合引起的弯曲角度。
作者：Jinyu Li, Philip C. Nelson, and M. D. Betterton
论文ID：physics/0607267
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2007-05-23