蛋白质折叠的平均场描述：疏水性轮廓和折叠核的进化保守性
摘要：演化上保守的数量，指定了折叠核心，通过一个小蛋白质（PDB代码：1ten）的案例研究进行了探索。首先证明了折叠核心上的氨基酸序列是不保守的。然后考虑了结构的3D（三维）信息，并发现3D疏水性剖面对于指定折叠核心和演化上保守至关重要。这个剖面通过在原生态结构中实现的氨基酸间作用（包括熵效应）来维持。在考虑氨基酸序列中的接触距离的影响后，实验观察到的phi值与这个3D疏水性剖面相关。
作者：S. Nakamura and O. Narikiyo
论文ID：physics/0607219
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2007-05-23