蛋白质/DNA复合物的平衡研究:来自晶体结构数据

摘要:如何利用晶体结构数据和平衡统计力学的概念计算蛋白质/ DNA复合物的热力学,以TATA-box结合蛋白(TBP)/ TATA序列复合物为例。我们估计了每个碱基对的自由能和熵的变化。从自由能的曲率估计了DNA的局部刚性。我们还估计了与特定碱基对形成键的蛋白质的自由能增益。因此,我们找出了负责特定结合的碱基对。

作者:Sudipta Samanta, J. Chakrabarti and Dhananjay Bhattacharyya

论文ID:physics/0607143

分类:Biological Physics

分类简称:physics.bio-ph

提交时间:2007-05-23

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