α螺旋中的振子-极化子。II. 两振子束缚态
摘要：螺旋上的两个振子动力学与3D α-螺旋的酰胺-I振动相关的广义Davydov模型描述。该螺旋由通过共价键连接的氢键缔合的肽单元的三个脊椎建模。结果表明，两振子能谱支持两种束缚态，称为TVBS-I和TVBS-II，它们分别与两个振子被捕获在同一酰胺-I模式和同一脊椎的两个最近邻酰胺-I模式上有关。在低温下，非零的脊椎间跳跃常数使得TVBS- I和TVBS-II的三维性质，波函数延伸到螺旋的三个脊椎。在生物温度下，成对的振子被限制在一个给定的脊椎上，并且显示出与一维模型描述的束缚态相同的特征。温度和螺旋的三维性质之间的相互作用也导致了第三种束缚态的出现，称为TVBS-III，它指的是两个振子被捕获在两个不同的脊椎上。通过模拟它们的红外泵浦探针光谱响应，讨论了束缚态存在的实验特征。最后，还讨论了两个振子束缚态的呼吸器样行为的基本问题。
作者：Cyril Falvo and Vincent Pouthier
论文ID：physics/0509140
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2009-11-11