DNA节点在弱和强电场中的凝胶电泳
摘要：使用凝胶电泳可以根据结的类型将等长的DNA（切口圆形）分离开来。在低电场下，复杂的结比简单的结更紧凑，漂移速度更快。最近的实验证明，从低电场转变到高电场时，漂移速度对结类型的依赖关系发生了反转。我们在一个拓扑限制的介质中，使用一个简单的蒙特卡洛算法，在一个封闭的、打结的、带电的DNA链上进行计算机模拟，在外部电场中漂移。通过研究DNA分子的电泳迁移对结类型和电场强度的依赖关系，我们得出了结果。结果与在低和高电场条件下的电泳实验结果有定性上的一致性：尤其是从低电场到高电场的行为反转得到了复制。结拓扑对问题施加了自我回避的限制，这是在强电场中观察到的行为的最终原因。
作者：C.Weber, A.Stasiak, M.Fleurant, P.De Los Rios and G.Dietler
论文ID：physics/0503097
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2009-11-11