PC集群机器配备低延迟通信软件
摘要：使用Linux操作系统和MPI（消息传递接口）构建了一台高性能的Beowulf（PC集群）机器，使用千兆以太网和通信软件GAMMA（Genoa Active Message Machine），而不是标准的TCP/IP协议进行处理器间通信。利用了快速的C/Fortran编译器和GAMMA通信库。这种方法消除了TCP/IP的大通信开销，并显著提高了真实应用程序（包括第一性原理分子动力学模拟代码）的计算性能。GAMMA通信还通过处理器数量的可扩展性和长时间（数天）的可靠性进行了验证。 关键词：非TCP/IP，主动消息，小延迟，快速C/Fortran编译器，第一性原理（量子力学）分子动力学，先进材料
作者：Motohiko Tanaka
论文ID：physics/0407152
分类：Computational Physics
分类简称：physics.comp-ph
提交时间：2007-05-23