bdbms -- 一种用于生物数据的数据库管理系统
摘要:生物学家们越来越多地使用数据库来存储和管理他们的数据。生物数据库通常包含来自各种来源的原始数据、元数据、序列、注释和相关数据的混合。当前的数据库技术缺乏生物数据库所需的几个功能。本文介绍了bdbms,它是一个可扩展的原型数据库管理系统,用于支持生物数据。bdbms扩展了当前DBMS的功能,包括:(1)注释和来源管理,包括在bdbms中存储、索引、操作和查询注释和来源作为第一类对象,(2)本地依赖跟踪,用于跟踪数据项之间的依赖关系和推导关系,(3)更新授权,支持基于内容的授权进行数据管理,与基于身份的授权相比,(4)新的访问方法及其支持的运算符,支持对各种类型的压缩生物数据进行模式匹配。本文介绍了bdbms的设计以及支持这些功能的提出的技术,包括对SQL的扩展。我们还概述了建立bdbms时面临的一些未解决问题。
作者:Mohamed Y. Eltabakh, Mourad Ouzzani, Walid G. Aref
论文ID:cs/0612127
分类:Databases
分类简称:cs.DB
提交时间:2007-05-23