新颖酶用于多环芳烃的生物降解：基于宏基因组的鉴定与功能分析
摘要：土壤中的多环芳烃（PAHs）是高度有毒、致癌的物质。在受污染的土壤中，作物种植、畜牧业甚至土壤中微生物的生存都会受到严重干扰，这取决于污染程度。大多数微生物无法耐受受PAH污染的土壤，然而，一些微生物菌株可以适应这些恶劣环境并在受污染的土壤上生存。分析受污染的环境样品的宏基因组可能会发现适用于从生物催化到污染控制的绿色生物技术方法的PAH降解酶。在本研究中，我们的目标是应用宏基因组数据搜索来识别有效的土壤修复中新型酶。通过一系列生物信息学工具进一步分析宏基因组命中结果，以选择预测编码具有良好折叠可溶性酶的蛋白质序列。三种新型酶（两种双氧酶和一种过氧化物酶）被克隆并用于土壤修复微生态系统实验。发现这些新型酶对萘和菲的降解效率较高。添加无机氧化剂CaO2进一步增加了新型酶对蒽和芘的降解潜力。我们得出结论，宏基因组挖掘与生物信息学预测、结构建模和功能鉴定相结合是寻找土壤修复的新型酶的强大方法。
作者：Kinga K. Nagy, Krist''of Tak''acs, Imre N''emeth, B''alint Varga, Vince Grolmusz, M''onika Moln''ar, Be''ata G. V''ertessy
论文ID：2308.15914
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2023-08-31