非水离子对在分子动力学模拟中体现了包括电子极化的必要性
摘要：模拟带电物质的分子系统时，考虑电子极化是至关重要的。如果忽略电子极化，如在力场模拟中经常做的那样，溶液中的电荷相互作用可能被严重高估，导致离子与生物分子之间结合过强。电子连续介质修正通过缩放电荷，使其与溶剂环境的高频介电常数的平方根的倒数相关，以均场方式引入电子极化。在这里，我们使用从头分子动力学模拟量化了电子极化对模型非水环境中的同电荷离子对的影响，其中只有电子极化是介电响应。我们的研究结果证实了目前方法的概念上的有效性，并强调其适用于复杂的水生物分子系统。同时，目前的研究结果也证明了在力场开发中使用较弱的电荷缩放因子的潜在适应性。
作者：Vojtech Kostal, Pavel Jungwirth, Hector Martinez-Seara
论文ID：2308.05482
分类：Chemical Physics
分类简称：physics.chem-ph
提交时间：2023-08-11