mSigSDK -- 私密、大规模、突变签名的计算

摘要:无需下载或安装,我们先前工作表明在突变特征数据上进行分析是可行的,并且可以在不损害隐私的情况下以大规模分析个体患者数据。在此基础上,我们开发了一个名为mSigSDK的软件开发工具包(SDK),以促进分布式数据处理工作流和突变特征分析结果的图形可视化。我们严格遵守现代Web计算标准,特别是ECMAScript ES6框架(JavaScript模块)设定的模块化标准。我们的方法允许将计算完全委托给用户自己机器的计算资源(内置于浏览器中),无需任何下载或安装。mSigSDK主要作为国家癌症研究所癌症流行病学和遗传学科(NIH / NCI / DCEG)的mSig Portal资源的附属库开发,着重于其作为其他研究人员计算结构的可扩展性。预期的扩展包括对其他突变特征API生态系统(如SIGNAL和COSMIC)的编程操作,推进突变特征研究的数据共享(Grossman等人,2016年)。

作者:Aaron Ge, Yasmmin, Tongwu Zhang, Kailing Chen, Maria Teresa Landi, Brian Park, Jeya Balasubramanian, Jonas S Almeida

论文ID:2308.02995

分类:Genomics

分类简称:q-bio.GN

提交时间:2023-08-08

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