不可逆进化,适应性景观中的障碍和持久药物抗性
摘要:使用适应度图,或称为有向立方图,来分析进化的可逆性。主要应用是抗菌药物耐药性。可逆的耐药性在临床和实验证实中都观察到。如果药物耐药性依赖于单一的点突变,则可能的情景是,在停药后突变会恢复为野生型密码子,从而完全恢复敏感性。一般而言,停药并不意味着耐药性会自动消失。此外,如果药物耐药性是可逆的,则逆向进化的阈值浓度可能低于正向进化的阈值。为了理解进化的可逆性,包括阈值的非对称性,有必要分析适应度景观上的障碍。我们比较了局部和全局的障碍,正向和逆向进化的障碍,并猜测有利于正向进化的景观与进化可逆性相关。我们分析了次优峰值和高原,并观察了冗余和维度对其影响的一些观察结果。我们的发现与关于不可逆性疟疾耐药性的实验室研究进行了比较。
作者:Kristina Crona
论文ID:2307.14550
分类:Populations and Evolution
分类简称:q-bio.PE
提交时间:2023-07-28