时间反演路径采样加速动力学
摘要：加速确定转变速率的模拟在动力学和非平衡统计学中相对较少见且效果较差，与平衡热力学的各种增强抽样方法相比。我们基于时间可逆性推导出一种基于时间逆转路径抽样的方法（tRPS）来加速模拟。通过与直接模拟蛋白质折叠的比较，证明了tRPS的效果，tRPS给出了与直接模拟一致的结果，并且提高了效率高达五个数量级。该方法适用于连续或离散的变量。
作者：Zhirong Liu
论文ID：2307.12214
分类：Chemical Physics
分类简称：physics.chem-ph
提交时间：2023-07-25