转录因子搜索中无序区域的角色
摘要：转录因子（TF）是调控基因表达的蛋白质。调控机制是通过TF与与之相关的基因的特定部分结合，该部分是TF的目标。为了使调控有效，TF必须能够与正确的目标结合，并且应该能够快速地完成这一过程，以便允许细胞适当的反应时间，例如发现食物或检测毒素。同时，搜索过程受限于扩散（缓慢）运动和饱和了“虚假”目标的环境，即其他具有类似序列的DNA的部分。在真核细胞中，许多TF具有固有无序区域（IDR）-一条由成百上千个氨基酸构成的长聚合物“尾巴”。已经证明，某些TF的IDR在搜索过程中起到关键作用，本文中我们开发了一个模型，试图解释其贡献。我们展示了IDR使TF与其相应的目标具有高亲和性，并且它所做的方式也可以缩短搜索时间。
作者：Wencheng Ji, Ori Hachmo, Naama Barkai, and Ariel Amir
论文ID：2307.11180
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2023-07-24