实验元种群中的中性多样性
摘要：通过自动化和高通量的方法，可以操作和选择大量的细菌种群。在本文中，我们对在这种设置中产生的中性多样性模式感兴趣，其中许多细菌种群在平行连续转移中生长，在某些情况下会发生整体灭绝和分裂事件。我们以出生-死亡过程模拟细菌的生长，并使用凝聚点过程的理论。我们展示了存在一种稀释因子，可以优化给定周期下中性多样性的期望量，并研究了不同实验模式下突变频率谱的幂律行为。我们还通过建立一种新的公式来研究中性变异在最近分裂的两个种群之间的差异，用于预测共享和私有突变的预期数量。最后，我们展示了这种设置在选择需要多个突变的感兴趣表型方面的应用价值。
作者：Guilhem Doulcier, Amaury Lambert
论文ID：2307.06393
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2023-07-14