基于KDE的具有相关三体分子内相互作用的半晶体系统粗粒化
摘要：通过扩展迭代Boltzmann反演方法来生成具有三体分子内势能的粗粒化模型，可以重现结构分布函数中的相关性。使用核密度估计计算粗粒化的结构分布函数，以产生具有可控平滑度的解析可微分的分布函数，通过核带宽参数进行平滑。采用双三次插值方法准确地插值由该方法训练的三体势能。为了证明这种新方法，构建了一个聚乙烯的粗粒化模型，其中每个珠子代表一个乙烯单体。所得模型在计算成本仅增加10%的情况下，重现了径向密度函数以及从目标原子模拟中采样的键长和键角联合概率分布。通过该新方法开发的模型对结晶动力学的预测分析揭示了带宽参数可以调节以加速聚合物结晶建模。具体而言，用较大的带宽计算目标RDF会减缓二次结晶，而增加键长和键角分布的带宽会降低主要结晶速率。
作者：Jianlan Ye, Vipin Agrawal, Minghao Liu, Jing Hu, Jay Oswald
论文ID：2307.04067
分类：Computational Physics
分类简称：physics.comp-ph
提交时间：2023-07-11