提升科学发现速率的更好研究软件工具--或者为什么我们需要投资于研究软件工程
摘要：生物图像分析是一个年轻的计算领域，与生命科学密切合作，对科学图像数据进行定量分析。在过去的十年中，取得了巨大的进展，不少新的方法都被封装为可用的软件工具，用户现在可以通过软件工具（如ilastik、cellprofiler、Fiji/ImageJ2等）常规地应用尖端方法解决分析问题。这类软件工具现在已经成为科学的基础设施的一部分。不幸的是，除了少数几个有持久影响的例外，许多其他潜在有用的工具未能进入用户手中。虽然这样的原因有很多，但我们认为至少其中一些潜在问题可以得到缓解。在这篇观点文章中，我们特别主张在成像和图像分析核心设施中嵌入研究软件工程师（RSEs）团队将是可持续发展生物图像分析软件的重要一步。
作者：Joran Deschamps, Damian Dalle Nogare, Florian Jug
论文ID：2307.03934
分类：Other Quantitative Biology
分类简称：q-bio.OT
提交时间：2023-07-11