K-Ras表面的连续转化水合动力学斑块
摘要：信号传导通路中涉及的蛋白质是ODNP实验分析的一个有趣的目标，该实验可确定蛋白质表面的平移运动性。然而，由于所有位点的水合动力学仍然相对迅速，要求敏感的测量能够提取更细微的差异，因此这也构成了一个挑战。通过针对蛋白质K-Ras进行定位，我们发现ODNP交叉松弛度数值在3D空间中相似的区域内保持一致，不论自旋探针用于选择位置的具体残基是哪一个。从附近残基观察到的类似动力学表明，在纳米尺度上，水的平移动力学具有持久性和均匀性。这一结果是合理的，因为它本质上意味着在液态水表现出结构持久性（即相关长度）的长度尺度（纳米）上，水的动力学保持一致。这为战略性和全面地绘制水合层在水溶液中打开了可能性，并且可以确定对结合相互作用自由能有显著贡献的区域，例如可能对熵有重要贡献的缓慢水，或具有强烈温度依赖的水动力学的区域，可能对焓有重要贡献。
作者：Farhana Syed, Jessica N. Khuc, Alexandria Guinness, John M Franck
论文ID：2307.03179
分类：Soft Condensed Matter
分类简称：cond-mat.soft
提交时间：2023-07-11