关于空间Lambda-Fleming-Viot模型与分析地理参考遗传数据的其他过程之间的联系
摘要：空间Λ-Fleming-Viot模型（LV）引入在人群遗传学中主要是由Alison Etheridge的开创性工作推动的，与Nick Barton和Amandine V''eber合作大约十年前（1,2）. LV模型为描述一群相关个体在空间连续中的演化提供了坚实的数学框架。它减轻了Wright和Mal''ecot隔离距离模型中的“环带之痛”问题，具有抽样一致性，成为统计推断的选择工具。然而，目前对于LV模型与生成树和相应分支线的空间坐标之间的潜在联系知之甚少。本文侧重于LV的一个版本，其中谱系在无限小的距离上移动无限快。通过模拟，我们展示了LV生成树过程的近似出生-死亡模型。我们的结果还表明，用布朗运动模拟谱系在出生-死亡树上的移动通常无法很好地近似LV，原因是栖息地边界效应在长期内起着越来越重要的作用。最后，我们描述了快速模拟LV模型向前和向后时间版本的高效算法。
作者：Johannes Wirtz and St''ephane Guindon
论文ID：2307.02431
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2023-07-06