功能预测
摘要：结构生物信息学领域的介绍性教材相对较少，而蛋白质结构、分子模拟、热力学和生物信息学方法的教材相对较多。本书旨在介绍结构生物信息学，该领域将前述主题融合在一起，通过计算分析来探索三维蛋白质结构。我们概述现有的计算技术，用于验证、模拟、预测和分析蛋白质结构。更重要的是，它将提供关于如何和何时使用这些技术的实用知识。我们将从三个主要角度考虑蛋白质：蛋白质结构的量化、蛋白质结构预测和蛋白质模拟与动态。 对于理解蛋白质的分子功能仍存在巨大的差距。这引发了问题，即在没有直接实验知识的情况下，我们如何预测蛋白质功能。蛋白质功能是一个广泛的概念，涵盖不同尺度的内容：从催化酶反应的量子尺度效应到在生物体水平上显现的表型。实际上，许多这些功能尺度完全是不同的研究领域。在这里，我们将考虑预测范围较小的功能，大致涵盖蛋白质残基水平到通路水平。我们将对我们可以预测蛋白质的哪些功能方面、目前可用的方法以及它们在实践中的效果进行概念性概述。
作者：Bas Stringer, Annika Jacobsen, Qingzhen Hou, Hans de Ferrante, Olga Ivanova, Katharina Waury, Jose Gavald''a-Garci''a, Sanne Abeln, K. Anton Feenstra
论文ID：2307.02173
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2023-07-10