利用系统生物学方法鉴定HBV相关肝细胞癌中下调的关键基因和通路
摘要：慢性乙型肝炎（CHB）是肝细胞癌（HCC）发生的独立危险因素，无需肝硬化。除了肿瘤切除后一些抗病毒药物对HCC患者的生存有积极影响外，使用这些药物终身是必要的。因此，设计针对靶向的治疗策略以增加HCC患者的预期寿命非常重要。本研究旨在使用基于系统生物学方法的途径，鉴定HB相关HCC中的下调的核心基因和富集途径。从基因表达纲目数据库（GEO）下载了GSE121248的微阵列数据。选取在调整后p<0.05和Log Fold-change（FC）<-1.5的差异表达基因（DEGs）。然后，检测出具有最高中心性的基因。最后，评估核心基因的预后价值。包括IGF-1、PTGS2、PLG、HGF、ESR-1和CYP2B6等6个下调的具有最高交互度、介数中心性和特征向量中心性的核心基因。在具有高中心性的基因中，包括CYP2C9、ESR-1、CXCL2、CYP2C8、IGF-1、CYP3A4、CYP2E1、CERPINE-1和PXR在HCC中具有预后价值。重要的抑制途径包括代谢途径以及PI3K-Akt和趋化因子信号途径。与代谢、分化和趋化有关的多个基因的下调可能是HCC进展的标志，可作为诊断和治疗靶点。
作者：Sedigheh Behrouzifar
论文ID：2306.16173
分类：Molecular Networks
分类简称：q-bio.MN
提交时间：2023-06-29