通过分析多个mRNA微阵列和microRNA表达数据集，鉴定胰腺癌的预后生物标志物。
摘要：胰腺癌是目前癌症相关死亡的第四大原因，拥有近5％的5年耐用率。先前的几项研究已经解决了早期诊断在提高耐用率方面的功能，并且已经使用了多种在线工具来区分预后生物标志物，这是一个漫长的过程。我们相信统计特征选择方法可以在这里产生更好和更快的结果。为了验证我们的观点，我们选择了三个不同的mRNA微阵列（GSE15471、GSE28735和GSE16515）和一个microRNA（GSE41372）数据集，用于鉴定差异表达的基因（DEGs）和差异表达的microRNA（DEMs）。通过采用一些特征选择方法，选出了178个DEGs和16个DEMs。在确定DEMs的靶基因后，我们选择了两个DEGs（ECT2和NRP2），这两个基因也在DEMs的靶基因中被确定。此外，总体耐用性报告表明ECT2和NRP2与较差的总体生存率相关。因此，我们得出结论，在胰腺癌中，统计特征选择方法在生物标记物鉴定方面的表现确实比预定义的在线程序更好，而在这里，ECT2和NRP2可以作为可能的预后生物标志物。我们的所有资源、程序和文献片段都可以在https://github.com/Srizon143005/PancreaticCancerBiomarkers找到。
作者：Azmain Yakin Srizon
论文ID：2306.12320
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2023-06-22