simmr:一个用于在R中拟合稳定同位素混合模型的软件包
摘要:用R软件包介绍通过马尔可夫链蒙特卡洛和变分贝叶斯来拟合稳定同位素混合模型(SIMMs)。该软件包主要用于估计从动物的稳定同位素比率测量中摄入的食物来源的饮食贡献。它还可用于估计已知来源的混合物的比例贡献,例如河流沉积物的分摊等。该软件包具有简单的结构,使非专业用户能够与软件包进行交互,大部分计算复杂性都隐藏在主要的拟合函数背后。在本文中,我们详细介绍了这些函数的背景,并提供了软件包使用的案例研究。更多示例可在在线的软件包说明中找到。
作者:Emma Govan, Andrew L. Jackson, Richard Inger, Stuart Bearhop, Andrew C. Parnell
论文ID:2306.07817
分类:Applications
分类简称:stat.AP
提交时间:2023-06-14