从其完全核置换-反演群的商空间上复制反应路径图形状空间

摘要:发展了一个算法,可以从潜在搜索算法的输出中在形状空间中重现反应路径图(RRMs)。为了证明这一点,利用GRRM作为潜在搜索算法,但是原则上提出的算法也可以适用于其他潜在搜索算法。所提出的算法不需要对分子构型进行编码,因此适用于复杂的现实分子,其高效编码不容易获得。我们展示了一个RRM的子图通过对称群的作用而相互映射是同构的,并提供了一个算法来计算可行变换的集合(在Longuet-Higgins的意义下)。我们在玩具模型和更现实的分子中展示了所提出的算法。最后,我们从我们的角度对绝对速率理论进行了评述。

作者:Hiroshi Teramoto, Takuya Saito, Masamitsu Aoki, Burai Murayama, Masato Kobayashi, Takenobu Nakamura, Tetsuya Taketsugu

论文ID:2305.08072

分类:Chemical Physics

分类简称:physics.chem-ph

提交时间:2023-08-31

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