结构-功能动力学混合建模：RNA降解
摘要：RNA结构和功能动力学在控制生物系统方面起着基础性的作用。分子动力学模拟可以以原子级别表征相互作用，可以促进对新药物发现、制造和传递机制的理解。然而，计算上无法支持酶反应网络机制学习的数字孪生体开发以及端到端生物过程设计和控制。因此，我们创建了一个混合的（"机械+机器学习"）模型，从原子到宏观级别表征了RNA结构和功能动力学的相互依赖关系。为了评估所提出的建模策略，在本文中，我们考虑了RNA降解，这是细胞生物学中影响基因表达的关键过程。RNA寿命预测的经验研究显示了所提出的多尺度生物过程混合建模策略的有希望的性能。
作者：Hua Zheng, Wei Xie, Paul Whitford, Ailun Wang, Chunsheng Fang, Wandi Xu
论文ID：2305.03925
分类：Molecular Networks
分类简称：q-bio.MN
提交时间：2023-06-21