发展的几何视角

摘要:细胞命运决策是复杂的基因调控网络的结果。这些网络模型已知的参数比数据所能确定的要多。受Waddington关于地形的隐喻的启发,最近的研究试图理解基因调控网络的几何性质。在这里,我们描述了构建这些地形的适当数学框架的最新结果。这使得能够构建与细胞行为一致的最小参数化模型。我们回顾了已有的使用几何模型来拟合细胞命运的实验数据的例子,并描述了如何从几何角度理解细胞之间的空间相互作用。

作者:Archishman Raju, Eric D. Siggia

论文ID:2305.03366

分类:Quantitative Methods

分类简称:q-bio.QM

提交时间:2023-05-08

PDF 下载: 英文版 中文版pdf翻译中