进一步近似置换排序的障碍
摘要:转位距离问题(TDP)是基因组重排中的一个经典问题,它寻求确定将线性染色体转变为由排列$pi$和$sigma$表示的另一个染色体所需的最小转位次数。本文主要关注转位排序问题(SBT),其中$sigma$是单位排列$iota$。具体而言,我们研究了一类难以排序的排列,称为palisades,它们需要比Bafna和Pevzner提出的下界更多的转位次数。通过确定palisades的转位距离,我们能够提供$3$-排列(TD3)的精确转位直径,这是对简化技术进行近似解研究时对称群$S\_n$的一种特殊子集。自从Elias和Hartman给出了它的上界以来,TD3的确切值一直未知。确定palisades的转位距离的另一个结果是,在使用Bafna和Pevzner的下界作为近似SBT的保证时,无法确保近似比低于$1.375$。这一发现对于SBT的研究有重要影响,因为在过去的25年里,该问题一直受到密集的研究努力。
作者:Luiz Augusto G. da Silva, Luis Antonio B. Kowada and Maria Em''ilia M. T. Walter
论文ID:2304.13996
分类:Data Structures and Algorithms
分类简称:cs.DS
提交时间:2023-07-11