揭示RNA聚合酶空间互作对基因表达噪声的影响：未成熟和成熟RNA数量的分析分布
摘要：基于勘误，主要解决了有关于转录延伸的机制特征的遗漏。一种基因表达模型被构建，描述了非活跃和活跃状态之间的启动子切换，活跃状态下RNA聚合酶的结合，沿基因的随机移动包括立体作用，并且完全解离导致成熟的转录本随后降解。我们推导出了开始状态下与成熟的RNA数量的稳态分布，在两种重要的限制情况下：慢启动子切换和恒定表达。我们发现RNA波动被RNA聚合酶之间的立体作用抑制，这种抑制甚至可能导致次泊松型波动；这种效应在起始RNA中最为显著，在成熟RNA中相对较不明显，因为后者不是转录的直接传感器。我们发现机械微观模型和其他模型之间的参数之间存在关系，确保了它们对于参数空间的广泛预测的第一和第二RNA数量矩的一致性，包括慢速、中间速度和快速启动子切换，并且RNA数量分布是泊松型或超泊松型。此外，我们还确定了从成熟RNA数据中获得的信息的限制，特别是表明它无法区分基因上高度不同的RNA聚合酶流量模式。
作者：Juraj Szavits-Nossan and Ramon Grima
论文ID：2304.05304
分类：Subcellular Processes
分类简称：q-bio.SC
提交时间：2023-08-17