表面化学反应网络中的重构复杂性

摘要:基本重新配置问题的计算复杂性。已经介绍的表面化学反应网络的(sCRNs)的表面计算复杂性,其中有序对相邻种类以非确定性方式根据预定义的允许的转化规则(化学反应)转化为不同的有序对。特别地,用于sCRNs模拟的两个基本问题是:在给定一组转化规则的情况下,一个给定的分子配置能否转化为另一个给定的配置;以及在给定一组转化规则的情况下,一个给定的细胞能否包含特定种类的分子。我们展示了这些问题在不同的环境中可以在多项式时间内解决,是NP完全或PSPACE完全的。包括当相邻种类只进行交换而不是任意转化(交换sCRNs)时,以及细胞可以有限次地改变种类(k燃尽)。大多数问题都至少是NP难的,除非只有很少的不同种类(2个或3个)。

作者:Robert M. Alaniz and Josh Brunner and Michael Coulombe and Erik D. Demaine and Yevhenii Diomidov and Ryan Knobel and Timothy Gomez and Elise Grizzell and Jayson Lynch and Andrew Rodriguez and Robert Schweller and Tim Wylie

论文ID:2303.15556

分类:Computational Complexity

分类简称:cs.CC

提交时间:2023-03-29

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