细胞外蛋白质合成系统中的氨基酸平衡用于蛋白质浓度的预测和评估
摘要：无细胞蛋白质合成（CFPS）系统是一种补充常规基于细胞的蛋白质合成的吸引人的方法，特别适用于筛选方法。文献描述了各种CFPS系统，但由于反应组分的浓度常常不同，因此其性能难以比较。因此，我们开发了一种基于氨基酸平衡的计算工具，通过确定理论可实现和实际达到的蛋白质摩尔浓度之比来评估CFPS的性能。这个工具被应用于我们实验室的一系列实验和文献中描述的各种系统，以识别那些非常高效合成蛋白质的系统以及仍有潜力提高产量的系统。公认的大肠杆菌系统在氨基酸利用效率方面表现出较高的效率，但有趣的是，鲜为人知的系统，如基于蓝链霉菌的系统，也展示了100％的异常的分子收率，即完全的氨基酸转化。这里描述的方法和工具可以快速识别系统是否达到了其最大值或存在其他限制。我们相信，这里描述的方法将有助于评估和优化现有的CFPS系统，并为系统开发新的CFPS系统奠定基础。
作者：Jascha Rolf, Julian Handke, Frank Burzinski, Stephan Luetz, Katrin Rosenthal
论文ID：2303.06639
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2023-03-14