解开关联图谱中的连锁和种群结构
摘要：基因组关联研究（GWAS）通过检测基因组上的单核苷酸多态性标记来定位特征的潜在因果变异。由于很少直接观察到因果变异，因此基于基因型标志物的替代模型被广泛考虑。尽管已经提出了估计替代模型参数的许多方法，但替代模型与真正的因果模型之间的关系尚未得到调查。在这项工作中，我们建立了替代模型和真正因果模型之间的关系。这种联系表明，通过对感兴趣的变异进行建模而不是特征，GWAS考虑到了种群结构。这种观察解释了如何使用遗传协变量部分纠正环境混杂以及为何先前声称的PC校正与线性混合模型之间的关系是不正确的。
作者：Hanbin Lee, Moo Hyuk Lee
论文ID：2303.00904
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2023-03-03