多重网络对齐中新的基于GO的度量及其统计显著性
摘要：多蛋白相互作用（PPI）网络提供了对生物系统功能的宝贵洞察，而对多个PPI网络进行对齐可以揭示不同物种之间的重要功能关系。然而，评估多个网络对齐的质量是一个具有挑战性的问题。在本文中，我们提出了两个新的指标，即平方GO得分（SGS）和暴露G得分，用于评估多个网络对齐的质量，同时利用Gene Ontology（GO）术语的功能信息。我们还引入了一个$p$-value测量，即统计暴露G得分，用于计算基于其揭示的GO术语的多个网络对齐的确切显著性。我们还证明了我们的指标与恢复的正交计数高度相关，进一步证明了它们的有效性。我们的工作为开发更可靠和准确的度量指标，评估多个网络对齐，并在使用多个网络对齐预测基因功能和识别不同物种之间的进化关系方面具有潜在应用。
作者：Reza Mousapour, Kimia Yazdani, Wayne B. Hayes
论文ID：2302.13440
分类：Molecular Networks
分类简称：q-bio.MN
提交时间：2023-02-28