建模多稳态基因调控网络的理论和计算工具
摘要：基因调控网络动力学的理论和计算模型在过去十年里快速增长，这些相互作用是如何导致多稳态和异质细胞群体的。随着理论建模在描述基因和生化电路方面的应用越来越广泛，具备数学和物理背景的理论家常常将统计物理学、非线性动力学和网络理论的概念应用于生物系统。本综述旨在清晰概述该领域中最重要的方法，并突出当前和未来的挑战。它还包括解决和模拟该领域中使用的一些典型生物系统模型的实际操作教程。此外，我们提供了现有文献中的具体例子，供希望探索这个快速发展领域的理论家参考。在可能的情况下，我们还强调了生化和调控网络与非平衡统计物理学和量子力学中通常研究的“经典”系统之间的相似性和差异。
作者：Federico Bocci, Dongya Jia, Qing Nie, Mohit Kumar Jolly, Jose Onuchic
论文ID：2302.07401
分类：Molecular Networks
分类简称：q-bio.MN
提交时间：2023-06-28