分子表示的持续Dirac
摘要：分子表示对于分子系统的建模和分析非常重要。基于拓扑数据分析（TDA）的表示模型和一般方法在药物设计和材料发现的各个环节中取得了巨大成功。在这里，我们基于持续的狄拉克算子开发了一个数学严密的计算框架来进行分子表示。系统地讨论了离散加权和非加权狄拉克矩阵的谱特性，并用于展示实际分子结构的非同源和同源特征向量的几何和拓扑特性。这使我们能够评估权重方案对狄拉克特征谱中编码的信息的影响。我们提出了一系列描述狄拉克矩阵谱在滤波过程中特征的物理持续属性，并将其用作高效的分子指纹。最后，我们基于持续狄拉克模型对九种有机-无机卤化物钙钛矿的分子构型进行了聚类。我们发现我们的模型可以很好地聚类结构，展示了当前方法的表示和特征化能力。
作者：JunJie Wee, Ginestra Bianconi, Kelin Xia
论文ID：2302.02386
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2023-02-07