图中最大精确匹配的链接
摘要:在本文中,我们展示了如何将查询字符串$Q$与标记的有向无环图(G=(V,E))之间的最大精确匹配(MEMs)链起来,以解决$Q$和$G$之间的最长公共子序列(LCS)问题。我们通过对DAG中链接的新对称形式的求解,得到了我们的结果,其时间复杂度为$O(m+n+k^2|V|+|E|+kNlogN)$,其中$m=|Q|$,$n$是节点标签的总长度,$k$是覆盖G的节点所需的最小路径数,$N$是$Q$和节点标签之间的MEMs数量,我们展示了这些MEMs能够编码完整的MEMs。
作者:Nicola Rizzo, Manuel C''aceres, Veli M"akinen
论文ID:2302.01748
分类:Data Structures and Algorithms
分类简称:cs.DS
提交时间:2023-07-06