集合平均溶解能和溶质-溶剂界面波动的建模与分析
摘要：变分隐性溶剂模型(VISM)由于它们相对较低的计算成本和令人满意的准确性，在生物系统分子水溶解分析中得到了广泛应用。在VISM的构建中，一个界面分隔了溶质和溶剂。与锐界面模型相比，弥散界面VISM在提高生物分子溶解能量估计的效率和准确性方面显示了一些初步的成功。然而，在理论层面上，关于弥散界面VISM仍然存在一些问题：(1)弥散界面的物理意义是什么？(2)弥散界面VISM预测的是什么能量？本研究旨在解决上述问题。我们的研究揭示了弥散界面定义与溶质-溶剂界面由于热波动而发生的随机运动之间的关系。然后，我们利用这种弥散界面设置构建了一个能够捕获系列平均溶解能量的VISM，而这是溶解过程中的实验观察量。进一步研究了该模型的适合性和变分分析。我们的工作是使用弥散界面VISM估计系列平均溶解能量的第一步。
作者：Yuanzhen Shao, Zhan Shao, Shan Zhao
论文ID：2301.08560
分类：Biological Physics
分类简称：physics.bio-ph
提交时间：2023-01-23