超越外显子组:门迪利安遗传疾病诊断测试的下一步
摘要:对于临床遗传检测的进展,包括全外显子测序(ES)的引入,超过50%的疑似孟德尔遗传病的个体缺乏精确的分子诊断。临床评估越来越多地由临床遗传学以外的专科医生进行,通常以分层方式进行,通常在ES之后结束。目前的诊断率反映了多种因素,包括技术限制、对变异致病性的不完全理解、缺失的基因型与表型关联、基因环境的复杂相互作用以及临床实验室之间的报告差异。了解ES以外的诊断测试领域的快速发展及其局限性,对非遗传学专业人士来说是一项挑战。新的测试方法,如短读基因组或RNA测序,可能很难获得,并且目前尚无临床应用的新兴技术,如光学基因组映射和长读DNA或RNA测序。此外,在评价结果无定论后,也没有明确的指导下一步应该采取什么措施。在这里,我们回顾了为什么临床遗传评估可能是阴性的,讨论这种情况下应该提出的问题,并提供了进一步调查的框架,包括新方法的优缺点,这些方法在临床领域还很新。我们提供了一份基于表型和先前评估的无定论分子检测后的下一步指南,包括何时考虑转诊到GREGoR等协作组织,这些组织致力于阐明罕见未解决的遗传疾病的潜在原因。
作者:Monica H. Wojcik, Chloe M. Reuter, Shruti Marwaha, Medhat Mahmoud, Michael H. Duyzend, Hayk Barseghyan, Bo Yuan, Philip M. Boone, Emily E. Groopman, Emmanu`ele C. D''elot, Deepti Jain, Alba Sanchis-Juan, Genomics Research to Elucidate the Genetics of Rare Diseases (GREGoR) Consortium, Lea M. Starita, Michael Talkowski, Stephen B. Montgomery, Michael J. Bamshad, Jessica X. Chong, Matthew T. Wheeler, Seth I. Berger, Anne O'Donnell-Luria, Fritz J. Sedlazeck, Danny E. Miller
论文ID:2301.07363
分类:Genomics
分类简称:q-bio.GN
提交时间:2023-01-19