利用Fano因子确定某些类型的基因自调节
摘要：通过蛋白质的自调控，可以调控一个基因的表达。尽管基因调控是生物学的一个核心课题，但自调控研究较少。通常情况下，用直接的生化方法确定自调控的存在是非常困难的。然而，一些论文观察到某些类型的自调控与基因表达中的噪声水平有关。我们通过在离散状态连续时间马尔可夫链上的两个命题来概括这些结果。这两个命题构成了一种简单而稳健的方法，可以通过基因表达数据推断在特定场景下是否存在自调控。这种方法只依赖于Fano因子，即基因表达水平的方差和均值的比值。与其他推断自调控的方法相比，我们的方法只需要一次的非干预性数据，并且不需要估计参数。此外，我们的方法对模型没有太多限制。我们将这种方法应用于四组实验数据，并发现一些可能存在自调控的基因。一些推断出的自调控已经通过实验证实或其他理论工作。
作者：Yue Wang and Siqi He
论文ID：2301.06692
分类：Molecular Networks
分类简称：q-bio.MN
提交时间：2023-03-31