确定最长公共子序列的唯一性的算法

摘要:在计算机科学中,给定多个数字序列,确定最长公共子序列是一个经典问题。该问题在生物信息学中有应用,尤其是确定可转座基因。然而,相关的研究只考虑了如何找到一个最长公共子序列。在本文中,我们考虑如何确定最长公共子序列的唯一性。如果存在多个最长公共子序列,我们还确定哪些数字出现在所有/部分/没有最长公共子序列中。我们关注四种情况:(1)没有重复数字的线性序列;(2)没有重复数字的循环序列;(3)有重复数字的线性序列;(4)有重复数字的循环序列。我们开发相应的算法并将其应用于基因序列数据。

作者:Yue Wang

论文ID:2301.03827

分类:Genomics

分类简称:q-bio.GN

提交时间:2023-03-31

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