设计批量、单细胞和空间转录组实验的统计功效分析：综述、教程与展望
摘要：基因表达谱技术已被用于各种应用，如癌症生物学。基因表达谱的发展拓展了转录组学研究中目标发现的范围，每种技术产生的数据具有不同的特征。为了确保利用转录组实验获得生物学上有意义的发现，通过进行统计功率分析以系统地考虑各种实验因素非常重要。在本文中，我们从实际角度对三种基因表达谱技术进行了功率分析的综述和讨论，包括批量RNA-seq，单细胞RNA-seq和高通量空间转录组学。具体而言，我们描述了针对每种批量RNA-seq和单细胞RNA-seq实验的每个研究目标的现有功率分析工具，并提出了建议。另一方面，由于目前尚无高通量空间转录组学的功率分析工具，我们相反地研究了可能影响功率分析的因素。
作者：Hyeongseon Jeon, Juan Xie, Yeseul Jeon, Kyeong Joo Jung, Arkobrato Gupta, Won Chang, Dongjun Chung
论文ID：2301.02918
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2023-01-10