元转录体分析用于元宏基因组中病毒基因组的二项系统学
摘要：神经复制分析（NRA）的有用性，在只基于病毒全基因组序列的知识而不涉及表型、功能、编码蛋白等其他数据，也不需要基因组序列比对的情况下，用于构建病毒基因组的自然双核分类的变体，这可能在处理宏基因组数据时有意义。这使得可以构建适用于病毒本身的双核分类。我们仅限于具有dsDNA环状基因组（乳头状病毒科、多瘤病毒科和菜花状病毒科）和部分具有ssDNA基因组的爱神庙病毒科，尽管所提出的方法也可以应用于其他的dsDNA、ssDNA和ssRNA病毒基因组，包括线性的（还介绍了部分Mitoviridae的结果）。我们认为，虽然病毒基因组的双核分类在所有情况下都很难应用，但它仍然是一个用于揭示病毒特性、寄主分布区域、疾病形式以及展示属于不同科和甚至不同界的病毒之间的联系的信息工具。
作者：Alexandr A. Ezhov
论文ID：2212.05476
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2022-12-13