带有重组的演化作为Metropolis-Hastings采样过程
摘要：进化遗传学的种群遗传模型：选择、突变、重组和漂变都被包括在内。通过n个家长的重组生成新的后代，从而实现可行性，并且无需使用扩散近似方法即可准确地表达任意适应性函数的突变选择平衡。虽然这种方法会强制产生后代之间的连锁平衡，但它允许分析具有连锁不平衡的整个人口。我们导出了适应性波动与对选择的响应之间的一般和精确关系。我们的假设允许对各种非平凡适应性函数的模型的定态分布进行分析计算。这些结果使我们能够探讨遗传体系结构，即不同适应性函数导致的定态分布。本文提出了推导有限和无限人口的定态状态的准确方法。这种方法可以应用于许多适应性函数，并且我们给出了其中四种的准确计算结果。这些结果使我们能够研究亚稳态、适应性函数之间的权衡以及考虑纠错编码。
作者：Jenny M. Poulton, Lee Altenberg, Chris Watkins
论文ID：2211.05032
分类：Populations and Evolution
分类简称：q-bio.PE
提交时间：2023-02-28