遗传序列的算术拓扑学
摘要：一种新的数学范式用于研究序列比对中的遗传变异。该框架是基于将当前分析基于的两两相对关系扩展到k-ary不相似性的概念。这种不相似性自然地导致了简单复合物的泛化，通过赋予简单形式权重，与边界算子相容。我们介绍了k-stance和不相似性复合物的概念，前者包含算术和拓扑结构，表达了这些k-ary关系。我们研究了不相似性复合物的基本数学性质，并展示了在SARS-CoV-2和H1N1流感基因组数据背景下，这种方法如何捕捉到生物学上相关的病毒动态的全新层面。
作者：Christopher Barrett, Andrei Bura, Qijun He, Fenix Huang, Christian Reidys
论文ID：2210.15029
分类：Quantitative Methods
分类简称：q-bio.QM
提交时间：2022-10-28