小鼠青光眼发生的RNA测序分析
摘要：青光眼是60岁以上人群中导致不可逆盲的主要原因，在2010年导致了6.6%至8%的全盲，但关于这种眼病的遗传起源仍有许多待探究之处。随着下一代测序技术（Next-Generation Sequencing，NGS）的现代发展，科学家开始更多地了解青光眼的遗传起源。该研究使用差异表达（DE）和基因本体论（GO）分析来研究严重青光眼小鼠与多个对照组之间的遗传差异。使用来自NCBI（NIH）的视神经头（ONH）和视网膜数据样本进行全基因组RNA表达的成对比较实验。此外，还采用主成分分析（PCA）和离散度可视化方法来对测序数据进行质量控制测试。还鉴定了具有偏斜基因计数的基因，因为它们可能是特定严重青光眼的标志基因。本试验中发现的基因本体支持青光眼起源的现有知识，从而确保结果的有效性。未来的研究人员可以彻底研究由DE和GO分析生成的基因列表，以寻找潜在的在小鼠青光眼中起激活或保护作用的基因，以开发治疗药物或基因疗法，以减缓或停止疾病的进展。总体目标是将来能够为人类制定这样的治疗方案，以改善青光眼患者的生活质量并降低青光眼导致的失明率。
作者：Jai Sharma, Vidhyacharan Bhaskar
论文ID：2210.01546
分类：Genomics
分类简称：q-bio.GN
提交时间：2022-10-05