研究配体结合动力学的计算方法的最新进展
摘要：计算方法可以预测结合动力学参数与药物的有效性相关，从而导致近年来开发了各种计算方法，用于预测结合动力学速率并了解蛋白质-药物结合路径和机制。在本综述中，我们介绍并比较近年来开发和应用于两个系统的计算方法：胰蛋白酶-苯甲酰胺和激酶抑制剂复合物。采用分子动力学模拟或机器学习中的增强采样方法可以用于预测动力学速率，并揭示调节停留时间、选择性和药物耐药性的因素。强调需要更少计算时间来进行预测的方法，并提出减少计算动力学速率误差的建议。
作者：Farzin Sohraby and Ariane Nunes-Alves
论文ID：2209.12537
分类：Biomolecules
分类简称：q-bio.BM
提交时间：2022-09-27